Der Verein Mütterzentrum Marburg e. V. wird in der Regel von einem fünfköpfigen Vorstand von Frauen geleitet. Aktuell sind der Posten der 1. Vorstandsvorsitzenden und eines Vorstandsmitglieds vakant. Die aktuell verbliebene Leitung besteht aus Miriam Klein, Eugenie Fink und Melanie Paulsen.
